В Башкирии зарегистрировано почти 2 тысячи религиозных организаций

Более 75% из них относятся к исламу — 1 503 объединения. Из них 655 входят в Центральное духовное управление мусульман России и 848 — в Духовное управление мусульман РБ.
Следующая по численности религиозная организация — Башкортостанская митрополия Русской православной церкви, которая насчитывает 372 организации. Среди других христианских течений выделяются христиане веры евангельской — 22 организации, евангельские христиане-баптисты — 17, Церковь евангельских христиан — 18 и другие.
В Башкирии также представлены старообрядцы (9 организаций), римско-католическая церковь (2), лютеране (4), есть армянская апостольская церковь (2), учреждения иудаизма (2), буддизма (4), а также сознание Кришны — 4 организации. Зарегистрированы также языческие верования (9), Церковь объединения (Муна) и мормоны (по одной).
